CRISPR文库

CRISPR筛选一般包括CRISPR敲除(CRISPRko)筛选、CRISPR激活(CRISPRa)筛选和CRISPR抑制(CRISPRi),文库靶向的每个基因都存在多个sgRNA。CRISPR敲除文库通常用于功能缺失筛选,因为靶基因序被Cas9突变所以CRISPR敲除的结果不可逆。而CRISPR激活筛选和CRISPR抑制筛选使用特殊的dCas9来抑制或激活靶基因,因此效果是可逆的。在选择CRISPR文库时,请注意一些文库载体含有Cas9(all-in-one),可以直接用于筛选;而另一些则需要与表达Cas9或dCas9细胞配合使用(2 plasmid)

CRISPR敲除(CRISPRko)
CRISPR敲除文库包括单载体系统(all-in-one)和双载体系统(需要Cas9表达细胞株)。CRISPR敲除文库可以在基因组的靶基因中产生插入或缺失突变,使其功能失活,适合各种体内体外筛选。本平台收录的v1版本文库每个基因3-5条sgRNA,v2版本的文库每个基因10条sgRNA。本平台文库分为全库和亚库,全库命中基因组中的所有基因,亚库则命中特定的基因家族、生物学过程或现象。亚库还根据基因数量从低到高分为基础版、扩大版(Plus)和最大版(Max)。此外,文库还包括一定数量的非靶向对照sgRNA。
文库名称
文库ID
物种
基因数量
gRNA/基因
总gRNA
备注
简介
SSLP011
Hum
19686
3
61058
简介
SSLP012
Hum
19686
3
61058
简介
SSLP013
Hum
2248
3
6994
简介
SSLP014
Hum
2794
3
8632
简介
SSLP015
Hum
2956
3
9118
简介
SSLP016
Hum
2121
3
6613
简介
SSLP017
Hum
2194
3
6832
简介
SSLP018
Hum
2314
3
7192
简介
SSLP019
Hum
2493
3
7729
简介
SSLP020
Hum
2566
3
7948
简介
SSLP021
Hum
797
4
3316
简介
SSLP022
Hum
1021
4
4253
简介
SSLP023
Hum
1649
4
6896
简介
SSLP024
Hum
773
4
3232
简介
SSLP025
Hum
372
4
1550
简介
SSLP026
Hum
1118
4
4652
简介
SSLP027
Hum
717
4
2988
简介
SSLP028
Hum
115
4
500
简介
SSLP029
Hum
813
4
3380
简介
SSLP030
Hum
118
6
748
简介
SSLP031
Hum
120
4
520
简介
SSLP032
Hum
392
4
1632
简介
SSLP033
Hum
简介
SSLP034
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3907
5
20540
简介
SSLP035
Hum
1624
10
16886
简介
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Hum
981
10
10210
简介
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Hum
770
10
8000
简介
SSLP038
Hum
1485
5
7725
简介
SSLP039
Hum
3162
5
16460
简介
SSLP040
Hum
398
10
4140
简介
SSLP041
Hum
1099
5
5710
简介
SSLP042
Hum
1734
5
9035
简介
SSLP043
Hum
756
10
7860
简介
SSLP044
Hum
903
10
9391
简介
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Hum
1518
5
7900
简介
SSLP046
Hum
147
10
1540
简介
SSLP047
Hum
19672
5
102173
简介
SSLP048
Hum
1845
5
9595
简介
SSLP049
Hum
2248
5
11690
简介
SSLP050
Hum
2794
5
14530
简介
SSLP051
Hum
2953
5
15365
简介
SSLP052
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2121
5
11029
简介
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11410
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5
12035
简介
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Hum
2489
5
12873
简介
SSLP056
Hum
2559
5
13214
简介
SSLP057
Hum
6049
5
31265
简介
SSLP070
Mus
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3
59228
简介
SSLP071
Mus
1233
4
5132
简介
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Mus
118
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512
简介
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Mus
337
4
1402
简介
SSLP074
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1185
4
4940
简介
SSLP075
Mus
826
4
3444
简介
SSLP076
Mus
3109
3
9577
简介
SSLP077
Mus
2009
3
6277
简介
SSLP078
Mus
1917
3
6001
简介
SSLP079
Mus
1989
3
6217
简介
SSLP080
Mus
2803
3
8659
简介
SSLP081
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1919
3
6007
简介
SSLP082
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2662
3
8236
简介
SSLP083
Mus
2668
3
8254
简介
SSLP084
Mus
747
10
7770
简介
SSLP085
Mus
762
10
7920
简介
SSLP086
Mus
1724
10
17938
简介
SSLP087
Mus
1044
10
10940
简介
SSLP088
Mus
423
10
4430
简介
SSLP089
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998
10
10380
简介
SSLP090
Mus
903
10
9430
简介
SSLP091
Mus
3336
3
11006
简介
SSLP092
Mus
1542
5
8020
简介
SSLP093
Mus
1576
5
8190
简介
SSLP094
Mus
1768
5
9200
简介
SSLP095
Mus
3203
5
16675
简介
SSLP096
Mus
126
10
1310
简介
SSLP097
Mus
6415
5
33075
简介
R73633
Mus
19674
4
78637
简介
R170511
Mus
19674
4
78637
CRISPR激活(CRISPRa)
CRISPR激活文库为双载体系统(需要配合dCas9-VPR表达细胞株)。CRISPR激活文库使用sgRNA引导dCas9-VPR靶向目标基因,从而激活其表达,适合各种体内体外筛选。本平台收录的v1版本文库每个基因3-5条sgRNA,v2版本的文库每个基因10条sgRNA。本平台文库分为全库和亚库,全库命中基因组中的所有基因,亚库则命中特定的基因家族、生物学过程或现象。亚库还根据基因数量从低到高分为基础版、扩大版(Plus)和最大版(Max)。此外,文库还包括一定数量的非靶向对照sgRNA。
文库名称
文库ID
物种
基因数量
gRNA/基因
总gRNA
备注
CRISPR抑制(CRISPRi)
CRISPR抑制文库为双载体系统(需要配合dCas9-KRAB表达细胞株)。CRISPR抑制文库使用sgRNA引导dCas9-KRAB靶向目标基因,从而抑制其表达,适合各种体内体外筛选。本平台收录的v1版本文库每个基因3-5条sgRNA,v2版本的文库每个基因10条sgRNA。本平台文库分为全库和亚库,全库命中基因组中的所有基因,亚库则命中特定的基因家族、生物学过程或现象。亚库还根据基因数量从低到高分为基础版、扩大版(Plus)和最大版(Max)。此外,文库还包括一定数量的非靶向对照sgRNA。
文库名称
文库ID
物种
基因数量
gRNA/基因
总gRNA
备注