CRISPR筛选一般包括CRISPR敲除(CRISPRko)筛选、CRISPR激活(CRISPRa)筛选和CRISPR抑制(CRISPRi),文库靶向的每个基因都存在多个sgRNA。CRISPR敲除文库通常用于功能缺失筛选,因为靶基因序被Cas9突变所以CRISPR敲除的结果不可逆。而CRISPR激活筛选和CRISPR抑制筛选使用特殊的dCas9来抑制或激活靶基因,因此效果是可逆的。在选择CRISPR文库时,请注意一些文库载体含有Cas9(all-in-one),可以直接用于筛选;而另一些则需要与表达Cas9或dCas9细胞配合使用(2 plasmid)。
文库名称
文库ID
物种
基因数量
gRNA/基因
总gRNA
备注
SSLP011
Hum
19686
3
61058
SSLP012
Hum
19686
3
61058
SSLP013
Hum
2248
3
6994
SSLP015
Hum
2956
3
9118
SSLP016
Hum
2121
3
6613
SSLP025
Hum
372
4
1550
SSLP028
Hum
115
4
500
SSLP029
Hum
813
4
3380
SSLP034
Hum
3907
5
20540
SSLP035
Hum
1624
10
16886
SSLP036
Hum
981
10
10210
SSLP040
Hum
398
10
4140
SSLP041
Hum
1099
5
5710
SSLP042
Hum
1734
5
9035
SSLP044
Hum
903
10
9391
SSLP046
Hum
147
10
1540
SSLP047
Hum
19672
5
102173
SSLP048
Hum
1845
5
9595
SSLP049
Hum
2248
5
11690
SSLP050
Hum
2794
5
14530
SSLP051
Hum
2953
5
15365
SSLP052
Hum
2121
5
11029
SSLP053
Hum
2194
5
11410
SSLP054
Hum
2314
5
12035
SSLP057
Hum
6049
5
31265
SSLP070
Mus
19076
3
59228
SSLP076
Mus
3109
3
9577
SSLP077
Mus
2009
3
6277
SSLP081
Mus
1919
3
6007
SSLP086
Mus
1724
10
17938
SSLP087
Mus
1044
10
10940
SSLP088
Mus
423
10
4430
SSLP089
Mus
998
10
10380
SSLP090
Mus
903
10
9430
SSLP092
Mus
1542
5
8020
SSLP096
Mus
126
10
1310
SSLP097
Mus
6415
5
33075
R73633
Mus
19674
4
78637
R170511
Mus
19674
4
78637
R110066
Hum
2981
~10
30290
SSLP059
Hum
5
31894
SSLP060
Hum
3162
5
16460
SSLP061
Hum
3162
5
16460
SSLP098
Mus
1185
4
4940
SSLP099
Mus
826
4
3444